[Publication] L'évolution "buissonnante" des orchidées du genre Ophrys, évaluée au moyen d'une approche "phylotranscriptomique"

Félicitations à Lucas Vandenabeele pour la publication du premier chapitre de sa thèse dans la revue Genome Biology and Evolution.

Que révèle ce travail ?

Dans cette étude, des membres du laboratoire LGDP, en collaboration avec des collègues du CEFREM et de la Station d’écologie théorique et expérimentale de Moulis (SETE), proposent une nouvelle hypothèse phylogénétique pour les orchidées du genre Ophrys.

Ces espèces d'orchidées possèdent des génomes complexes et de grande taille, ce qui a longtemps limité, et limite encore, les possibilités d'étudier leur évolution à l'échelle du génome entier. Afin de s'affranchir de cette contrainte, les auteurs se sont appuyés sur des transcriptomes floraux (gènes exprimés dans la fleur), permettant d'analyser près de 8000 gènes afin de mieux appréhender les relations entre les lignées principales de ce genre énigmatique. 

Différentes méthodes ont permis de mettre en évidence qu'en dépit de la forte aptitude à l'hybridation de ces espèces d'orchidées entre elles, un nombre au final assez restreint d'événements de flux de gènes majeurs et anciens ont "structuré" l'histoire évolutive du genre. 

Cette étude suggère aussi la possible origine hybride de certaines lignées du genre, comme la lignée tenthredinifera et des traces de flux de gènes entre lignées existantes et lignées aujourd'hui éteintes (des "introgressions fantômes"). 

Bien que l'hybridation soit intuitivement vue comme un phénomène homogénéisant, ces travaux confirment qu'une évolution, dite réticulée, pourrait bien dans certains cas catalyser la diversification de la biodiversité.

Référence de l'article :

Vandenabeele L., Gibert A., Salvado P., Buscail R., Llauro C., Laudié M., Philippe H. & Bertrand J. A. M.
Phylotranscriptomics Allows Distinguishing Major Gene Flow Events from Incomplete Lineage Sorting in Rapidly Diversifying Mimetic Orchids (Genus Ophrys).